Hola,
vediamo di fare un po' di ordine: su una Fedora 16 stai utilizzando KVM (il sistema di virtualizzazione integrato nel kernel). Il sistema virtualizzato è Win, solo che non riesci, nel sistema virtualizzato, alias in Win, a far funzionare le porte USB, giusto?
Se si, si potrebbe iniziare da qui ->
http://www.linux-kvm.org/page/USBBye 8-)