...tra il 2.4x.e il 2.6.x ci sono infinità di differenze

...per la seconda domanda, certo che puoi, l'unico problema saranno evventuali periferiche tipo webcam, SATA etc che potrebbero non più funzionarti a causa della mancanza del supporto nella versione 2.4.x
Per iniziare a dare un'occhiata al kernel (i cambi ad esempio da una versione ad un'altra) puoi partire da questo link ->
http://kernelnewbies.org/Bye
