..nel file xorg che hai postato c'è scritto;
If you have edited this file but would like it to be automatically updated
# again, run the following command:
# sudo dpkg-reconfigure -phigh xserver-xorg
...che dirti, prova a lanciare il comando riportato avviando in modalità failsafe con il kernel che non "ne vuole sapere".

...questi automatismi non mi sono mai piaciuti.
Siccome si va a toccare il file xorg.conf allora ti suggerisco di fare dapprima i backup dei dati importanti, anche se non dovesse accadere nulla ti ritrovi con un backup fatto.
Bye
